中央空調組合式機組一般不會造成堵塞。 目前的中央空調組合式機組防止堵塞的方法很多，因此有效地解決了堵塞的發生。

  結垢：當溫度大于60℃時，水中所含的鈣、鋁離子溶解，發生結垢。 中央空調組合式機組要求溫度控制在18℃～40℃范圍內，不易因結垢問題引起。 另外，由于新風內腔光滑，即使有輕微的水垢，也不易造成堵塞。

  大、細顆粒物：所有系統均配備過濾系統，可有效防止大、細顆粒物進入空氣。

  在中央空調組合式機組系統中，其他管道對新風有害：對于大中型系統的設計，一般根據板式換熱器選擇單獨的循環系統，并與新風系統分開。 

  抗腐蝕：采用耐腐蝕的管路和閥門部件。PPR原料具有良好的耐腐蝕性能，可以長期耐受強酸、強堿水溶液。

  生物污泥：螺旋閥可以主動分離，并成功去除水中溶解氣體，使中央空調組合式機組內的水保持在不飽和氣體含量，使系統內部氣體含量降低到0.5%范圍。如此，少量氣體供氧不易造成系統內的侵蝕和生物污泥。